Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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UFM1P61960 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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