Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms