Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX5P50542 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX5P50542 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX5P50542 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX5P50542 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX5P50542 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX5P50542 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PEX5P50542 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX5P50542 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms