Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP4P49662 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP4P49662 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP4P49662 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms