Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNPDA1P46926 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GNPDA1P46926 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNPDA1P46926 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GNPDA1P46926 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNPDA1P46926 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNPDA1P46926 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNPDA1P46926 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNPDA1P46926 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GNPDA1P46926 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GNPDA1P46926 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNPDA1P46926 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GNPDA1P46926 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GNPDA1P46926 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GNPDA1P46926 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GNPDA1P46926 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GNPDA1P46926 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms