Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
GRIK1P39086 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK1P39086 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms