Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA1P35221 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms