Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms