Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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