Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1P21675 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1P21675 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1P21675 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms