Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNB1P20700 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms