Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DESP17661 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DESP17661 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DESP17661 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DESP17661 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DESP17661 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DESP17661 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DESP17661 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DESP17661 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DESP17661 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms