Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms