Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms