Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTMAP06454 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTMAP06454 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTMAP06454 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms