Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APODP05090 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms