Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRATO95237 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRATO95237 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRATO95237 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRATO95237 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRATO95237 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRATO95237 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRATO95237 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRATO95237 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRATO95237 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRATO95237 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRATO95237 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms