Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms