Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TLR5O60602 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TLR5O60602 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TLR5O60602 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TLR5O60602 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TLR5O60602 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TLR5O60602 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TLR5O60602 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TLR5O60602 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TLR5O60602 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TLR5O60602 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TLR5O60602 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms