Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PCH4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PCH4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E9PCH4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E9PCH4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms