Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 NLRP2-209ENST00000537859 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms