Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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