Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP4B1Q9Y6B7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms