Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PHLDA3Q9Y5J5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms