Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB5Q9Y5E4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms