Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
WASHC2CQ9Y4E1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
WASHC2CQ9Y4E1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms