Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HCN4Q9Y3Q4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms