Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL11Q9Y3B7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL11Q9Y3B7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms