Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX24Q9Y343 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX24Q9Y343 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX24Q9Y343 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms