Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED16Q9Y2X0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED16Q9Y2X0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED16Q9Y2X0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms