Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR1DQ9Y2S0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR1DQ9Y2S0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms