Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL20Q9Y2M5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL20Q9Y2M5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms