Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP20Q9Y2K6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP20Q9Y2K6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms