Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HIGD1AQ9Y241 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms