Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN6Q9UQ52 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN6Q9UQ52 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN6Q9UQ52 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN6Q9UQ52 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN6Q9UQ52 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms