Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDZRN3Q9UPQ7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDZRN3Q9UPQ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDZRN3Q9UPQ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms