Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTF2Q9UNY4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTF2Q9UNY4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTF2Q9UNY4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms