Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX6Q9UNH7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.9 ms