Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4EQ9ULY5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms