Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNMA2Q9UL42 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNMA2Q9UL42 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms