Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACSIN3Q9UKS6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3Q9UKS6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3Q9UKS6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms