Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL4Q9UJQ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms