Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH22Q9UJ99 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH22Q9UJ99 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH22Q9UJ99 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms