Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABGEF1Q9UJ41 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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