Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CNOT7Q9UIV1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNOT7Q9UIV1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNOT7Q9UIV1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms