Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF1Q9UH73 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms