Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
IFT172Q9UG01 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT172Q9UG01 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms