Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NKX1-2Q9UD57 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKX1-2Q9UD57 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms