Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPASTQ9UBP0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPASTQ9UBP0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms