Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GALPQ9UBC7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALPQ9UBC7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms